Харьковский институт усовершенствования врачей был основан приказом Народного комиссариата здравоохранения (НКЗО) Украины от 10.11.1923 г.
С 1991 года институт подчинен Министерству здравоохранения Украины и переименован в Харьковский институт усовершенствования врачей, а в 1999 году - в Харьковскую медицинскую академию последипломного образования.
В Академии функционируют 64 кафедры, которые объединены в 5 факультетов: терапевтический, хирургический, педиатрический, медико-профилактический и организован впервые в Украине факультет общей практики семейной медицины. Учебный план и программа подготовки специалистов по специальности “общая практика - семейная медицина” включает 21 специальность.
Академия принимает участие во внедрении семейной медицины в практику здравоохранения Украины. С 2001 года работает учебно-научно-методическая лаборатория семейной медицины. С участием специалистов ХМАПО в Харьковский области в 2001 году открыто 104 амбулатории семейного врача.
По приказу МОЗ Украины в структуре Академии в 2002 году открыт медицинский колледж.
На протяжении последних лет в ХМАПО впервые в Украине разрабатывались и уже внедрены в работу критерии оценки качества работы преподавателя, которые включают в себя 4 направления: учебно-педагогическую работу, научную работу, лечебную работу, а также финансово-хозяйственную.
ХМАПО, имея все технические и педагогические возможности для развития сети дистанционного обучения, внедряет его на факультете “Менеджмент в здравоохранении”.
За последние годы Академией подготовлено и утверждено 10 программ интернатуры, 22 программы специализации, 55 программ предаттестационных циклов и компьютерные тесты для предаттестационных циклов.
Харьковская медицинская академия последипломного образования по уровню и качеству подготовки уверенно входит в мировое медицинского пространства.